おそらく、その通りです。

身長が伸びる時期には骨に「骨端線」という、いわば骨の「伸びしろ」があります。

ドクターがどのような意図で、もう身長が伸びないとお話されたかは分かりませんが、

骨端線はレントゲンを撮ればその有無は確認することができますので、予想や憶測で言ったわけではないと思います。